Prihlásenie

SMIEŠKOVÁ, Monika: Hromadné vlastnosti toku buniek vo výpočtovom modeli pre vývoj mikrofluidických zariadení. [Dizertačná práca] Žilinská univerzita v Žiline. Fakulta riadenia a informatiky. Katedra softvérových technológií. - Vedúca dizertačnej práce: doc. RNDr. Katarína Bachratá, PhD. – Žilina: FRI ZU, 2020, 114 s. Predložená dizertačná práca sa zaoberá výpočtovým modelovaním toku červených krviniek v mikrofluidických kanáloch. Simulačné experimenty boli realizované s využitím softvérového balíku ESPREesSo s voľne šíriteľným zdrojovým kódom. Práca sa zameriava na analýzu hromadných vlastností toku červených krviniek prirodzene sa vyskytujúcich v reálnych systémoch, ako sú vytváranie bezbunkovej vrstvy v blízkosti stien kanála alebo marginalizácia poškodených buniek. Jedným z cieľov práce bolo prostredníctvom týchto hemodynamických javov overiť hromadné vlastnosti toku buniek vo výpočtovom modeli. Samotnému výskumu mnohobunkových systémov na rozsiahlych simuláciách predchádzala kalibrácia a analýza medzibunkových interakcií. V práci je predstavená metodika procesu kalibrácie, ako aj výsledky interakčných parametrov pre konkrétne simulačné podmienky. Kľúčové slová: výpočtový model, medzibunkové interakcie, kalibrácia interakcií, hromadné vlastnosti toku červených krviniek, bezbunková vrstva

SMIEŠKOVÁ, Monika: Bulk properties of cell flow in a computational model for the development of microfluidic devices. [Dissertation thesis] - University of Žilina. Faculty of Management Science and Informatics. Department of Software Technology. - Supervisor: doc. RNDr. Katarína Bachratá, PhD. - Žilina, FRI ZU, 2020, 114 p. The presented dissertation thesis deals with computational modelling of red blood cell flow in microfluidic channels. Simulation experiments were performed using the ESPREesSo open-source software package. The work focuses on the analysis of the bulk properties of red blood cell flow naturally occurring in real systems, such as the formation of a cell-free layer near the canal walls or the marginalization of damaged cells. One of the aims of the work was to verify the bulk properties of cell flow in a computational model through hemodynamic phenomena. The research of multicellular systems on large-scale simulations was preceded by calibration and analysis of intercellular interactions. The work presents the methodology of the calibration process, as well as the results of interaction parameters for specific simulation conditions. Key words: computational model, cell-cell interactions, calibration of interactions, bulk properties of red blood cell flow, cell - free layer,