Prihlásenie

BUŠÍK, Martin: Vývoj a optimalizácia modelu pre tok buniek v kvapaline. [Dizertacná práca] Žilinská Univerzita v Žiline. Fakulta riadenia a informatiky. Katedra softvérových technológií. - Vedúci diplomovej práce: doc. Mgr. Ivanovi Cimrákovi, Dr. - Žilina: FRI ZU, 2017, 114 s. Dizertacná práca sa zaoberá analýzou, vývojom a aplikáciou výpoctového modelu slúžiaceho na popísanie prúdenia krvi. V používanom výpoctovom modeli je krv popísaná ako krvná plazma a v nej sa pohybujúce objekty, cervené krvinky. Hlavnými cielmi práce sú: Analýza výpoctového modelu, upresnenie modelu pre podrobnejšie popísanie skutocnosti, vývoj nových castí modelu a aplikácie modelu v biologickom výskume. Úvod práce obsahuje podrobný popis výpoctového modelu, ktorý je súcastou volne šíritelného programového balíka ESPResSo. Najväcšia cast práce je venovaná kalibrácii interakcie objekt-kvapalina pri metóde vnorenej hranice. V dalšej casti sa práca zaoberá zahrnutím viskóznych vlastností bunkovej membrány do výpoctového modelu. V závere sa práca venuje aplikáciám vyvíjaného modelu v biologickom výskume. Klúcové slová: Cervená krvinka, výpoctový model, metóda vnorenej hranice, viskozita, miera zachytávania, miera kolízií.

BUŠÍK, Martin: Development and optimization model for flow cells in the fluid. [Dissertation thesis] - University of Žilina. Faculty of Management Science and Informatics. Department of Software Technology. - Supervisor: doc. Mgr. Ivan Cimrák, Dr. - Žilina, FRI ZU, 2017, 114 p. This dissertation thesis contains analysis, development and application of computational model of blood flow. The main aims of this thesis are: Analysis of the computational model, model specification for description of the reality, development of new parts of the model and the application in biological research. We start with a description of computational model, which is distributed as part of the open source software ESPResSo. The main part of the thesis describes the object-fluid interaction, especially the immersed boundary method. In the next part of the work, we deal with implementation of membrane viscosity into the computational model. At the end of the work, we discuss applications of the model in biological research. Key words: Red blood cell, computational model, immersed boundary method, viscosity, capture rate, collision rate.